自2002年X檔案的六年后前聯(lián)邦探員丹娜·斯科莉（吉蓮·安德森 Gillian Anderson 飾）調任某教會(huì )醫院擔任醫師?？怂埂つ碌拢ù笮l·杜楚尼 David Duchovny 飾）則過(guò)著(zhù)隱居的生活繼續著(zhù)對超自然現象的關(guān)注某天FBI探員前來(lái)請求他們的幫助原來(lái)一段時(shí)間內維吉尼亞州接連有數名女子神秘失蹤其中甚至包括一名聯(lián)邦探員由于神父約瑟夫（Billy Connolly 飾）聲稱(chēng)看到了犯罪畫(huà)面因此FBI希望對超自然案件有著(zhù)豐富經(jīng)驗的穆德和斯科莉協(xié)助調查然而隨著(zhù)調查的深入穆德和斯科莉卻發(fā)現案件的黑暗遠遠超出他們的想象這對合作多年的搭檔面臨著(zhù)巨大的考驗…… 　　本片為同名美劇的第二部劇場(chǎng)版