白蓮教徒接下滿(mǎn)清大臣納蘭元述（甄子丹）所下的對付革命黨人的命令后在廣州街頭借“扶清滅洋”的口號大肆搗亂洋人的使館、教堂等地盤(pán)甚至連小學(xué)生也不放過(guò)他們的舉動(dòng)令黃飛鴻（李連杰）、十三姨（關(guān)之琳）與梁寬（莫少聰）異常氣憤 　　在某個(gè)醫學(xué)會(huì )議上黃飛鴻與革命黨領(lǐng)袖孫文（張鐵林）一見(jiàn)如故發(fā)現革命黨人對救國更具遠見(jiàn)時(shí)他決定幫助革命黨人逃過(guò)厄運隨后他直搗白蓮教總壇決勝九宮真人揭開(kāi)迷信假像又因奮慨國運衰竭民智末開(kāi)不惜與納蘭元述決一死戰